Nommé gouverneur du Khorasan [1], il prit son indépendance au point de créer une nouvelle dynastie locale en Perse les Tâhirides.
Tâhir ben Husayn a été le bras armé du calife Al-Mamûn pendant sa prise du pouvoir contre son frère Al-Amîn . Les armées de Al-Amîn venues d’Irak et de Syrie et celles de Al-Ma’mûn venue du Khorasan et conduites par Tâhir, s’affrontèrent une première fois près de Ray [2]. La bataille commença par un combat singulier entre les deux généraux, mais l’armée du Khorasan fit une charge qui mit en déroute l’armée de Bagdad. Al-Mamûn fut alors acclamé comme calife dans le Khorasan et le Tabarestan [3]. Al-Amîn se replia sur Bagdad où il dut faire face à des mutineries dans l’armée.
En 813, une nouvelle série de défaites à Bassora [4] et aux portes de Bagdad des armées de Bagdad, de nouvelles mutineries dans la troupe, et une révolte de la population de Bagdad ont obligé Al-Amîn à se replier dans les palais. Le 1er septembre 813, le palais fut pris d’assaut par les troupes de Al-Mamûn.
Tâhir, outrepassant les ordres du calife qui lui avait demandé de faire prisonnier Al-Amîn, le fit décapiter.
Tâhir a aussi participé à la reconquête de l’Irak après la période de dissidence conduite par Ibrahim, fils du calife Al-Mahdî. Les généraux de Bagdad apprenant l’arrivée d’Al-Mamûn, trahirent Ibrâhîm et se ralliaient à lui. Ibrâhîm s’est enfui, La ville de Bagdad reçut Al-Mamûn et Tâhir le 12 août 819 portant à nouveau le costume noir des abbassides [5].
En 821, en remerciement de ses services, Al-Mamûn a nommé Tâhir gouverneur du Khorasan. Cependant Al-Mamûn se méfiait de Tâhir surtout après avoir appris de Zubayda le récit de l’assassinat de Al-Amîn par Tahîr.
En 822, Tâhir a omis de citer le calife dans la prière du vendredi, déclarant ainsi son indépendance. Al-Mamûn avait introduit un esclave avec pour mission d’empoisonner Tâhir s’il venait à déclarer son indépendance. Le soir même, l’esclave accomplit sa mission et Tâhir fut assassiné.
Mamûn laissa Talha , le fils de Tâhir lui succéder. Cette décision allait sanctionner le démembrement de l’empire. Les Tâhirides, successeurs de Tâhir, peuvent être considérés comme les premiers instaurateurs d’un État indépendant en Iran après la conquête arabe en 642.