Avant son accession au patriarcat, il était ermite reclus dans une des îles d’Amastris [1].
En 705, l’empereur Justinien II, renversé en 695, reconquit son trône. Il déposa, fit aveugler et exila à Rome le patriarche Callinique 1er , qui avait participé au complot de 695. Il le remplaça par Cyrus, qui lui avait paraît-il prédit son rétablissement comme empereur. Cyrus fut historiquement le premier moine promu patriarche de Constantinople.
À la fin de l’année 711, Philippicos renversa et fit décapiter Justinien II. Adepte du monothélisme [2], il déposa le patriarche Cyrus et l’enferma dans le monastère Saint-Sauveur-in-Chora [3], le remplaçant par Jean VI.