Son élection, suscitée par l’empereur Frédéric 1er Barberousse contre le pape Alexandre III, prolongea le schisme ouvert en 1159 à la mort de Adrien IV par l’élection de Victor IV. Cette lutte « du Sacerdoce et de l’Empire » qui avait divisé la chrétienté en Victoriens et en Alexandrins, se prolongea ainsi par l’opposition des Pascaliens aux Alexandrins, chaque parti organisant des conciles nationaux.
En 1165, accédant à la demande de Frédéric 1er, Pascal III procéda à Aix-la-Chapelle à la canonisation de Charlemagne en 1167, à Rome, que l’empereur venait de prendre et de piller, incendiant la basilique Saint-Pierre, Pascal III couronna pour la seconde fois Frédéric 1er, ainsi que son épouse Béatrice de Bourgogne. Il meurt à Rome en 1168
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