Fils de Jean VIII de Bourbon-Vendôme et d’Isabelle de Beauvau. Il est l’ancêtre par les mâles du roi Henri IV
Âgé de 7 ans à la mort de son père, il fut placé sous la tutelle de son beau-frère Louis de Joyeuse .
En 1484, le roi Charles VIII, par ordonnance royale, fit directement dépendre Vendôme de la Couronne, le soustrayant de la vassalité de l’Anjou [1], qui venait d’ailleurs d’être réuni à la Couronne.
François de Bourbon accompagna le roi dans les guerres d’Italie et, par sa valeur et sa prudence, contribua à la victoire de Fornoue [2] en 1495, mais le comte mourut peu après à Verceil [3] en Italie le 30 octobre 1495 à l’âge de 25 ans.