Il consacra l’essentiel de son activité intellectuelle à une mise en ordre universelle des savoirs. Dans sa “ Clavis artis lullianae ” en 1609, il met au point l’instrument logique avec lequel il édifie son “Systema mnemonicum du plex” en 1610. Pour lui l’encyclopédie est à la fois science des principes de la connaissance et organisation d’ensemble des disciplines. Il énonce sa pensée dans “Philosophia digne restituta” en 1612.
Son Encyclopédie universelle en deux volumes en 1630, 35 livres répartis en 7 parties, où il intègre les trois “facultés supérieures”, droit, théologie, médecine, constitue la réalisation majeure de la pensée encyclopédique de son temps.