Elle descend par son père Martim Afonso Telo de Meneses du roi Fruela II des Asturies [1] et de León [2], et par sa mère Aldonça Anes de Vasconcelos, de Teresa Sanches, fille naturelle du roi Sanche 1er de Portugal .
Elle est mariée très jeune à João Lourenço de Cunha, fils de l’héritier de la seigneurie de Pombeiro, dont elle a un fils, Àlvaro da Cunha. On raconte que c’est lors d’une de ses visites à sa sœur, Maria Teles, dame de compagnie de l’infante Béatrice fille du roi Pierre 1er et d’Inés de Castro, que le roi Ferdinand 1er tombe amoureux d’elle. Sous prétexte de consanguinité, ce dernier obtient l’annulation de son mariage, provoquant un grand scandale et des troubles sociaux et politiques, faisant naître un climat d’insécurité dans le pays.
Le mariage avec le roi a secrètement lieu au monastère de Leça do Balio le 15 mai 1372. À la mi-février de l’année suivante, naît l’infante Béatrice.
Depuis longtemps déjà les reines de Portugal disposent d’importants revenus grâce à des biens acquis dans leur grande majorité par donation. Grâce à la générosité du roi Ferdinand, la reine reçoit ainsi de nombreuses villes ainsi que les fiefs de Sacavém [3], Frielas, Unhos et la terre de Melres, dans le Ribadouro.
Après la mort du roi Ferdinand, le 22 octobre 1383, Éléonore exerce la régence et son amant, le Galicien João Fernandes Andeiro, gagne une influence décisive à la cour. Cette liaison et cette influence déplaisent au plus haut point au peuple, à la bourgeoisie et à une partie de la noblesse, qui détestent la régente et craignent de se voir gouvernés par un souverain castillan.
Ce mécontentement général amène Jean (Jean 1er de Portugal) , grand-maître de l’ordre d’Aviz [4], soutenu par un groupe de nobles, parmi lesquels le jeune Nuno Álvares Pereira , à assassiner le comte d’Andeiro. Le meurtre est perpétré au palais, le 6 décembre 1383, et Jean d’Aviz réclame la régence.
La reine s’enfuit de Lisbonne, ralliée au maître d’Aviz, et se réfugie à Alenquer puis à Santarém [5], villes restées fidèles à sa cause, où elle tisse les intrigues politiques destinées à la maintenir au pouvoir.
L’évolution du conflit entre le grand-maître d’Aviz et le roi de Castille [6] réduit sa marge de manœuvre et elle fut finalement contrainte d’abdiquer la régence en faveur de son gendre Jean 1er de Castille.
Après la victoire de Jean d’Aviz, ce dernier se proclame régent puis roi de Portugal. En 1384, Jean 1er de Castille la fait enfermer au monastère de Tordesillas, près de Valladolid [7], où, selon certains historiens, elle meurt en 1386.