Fille de Berthold IV, duc de Méranie, et d’Agnès de Wettin. Elle est devenue reine de France par son mariage avec Philippe II de France. Veuf d’Isabelle de Hainaut, le roi Philippe II se remarie le 14 août 1193 avec Ingeburge de Danemark, mais pour des raisons encore inexpliquées, la prend en horreur le lendemain de sa nuit de noces, et fait annuler le mariage le 5 novembre 1193 par une assemblée d’évêques complaisants. Le 1er juin 1196, elle devient la 3ème épouse de Philippe Auguste.
Le pape Célestin III déclare l’annulation illégale le 13 mars 1195, mais Philippe II passe outre à la décision pontificale et se remarie.
Mais si le pape Célestin III meurt le 8 janvier 1198 sans avoir pu faire respecter sa décision, son successeur Innocent III entend confirmer la condamnation de l’annulation et la faire respecter. Après des négociations infructueuses, il lance le 13 janvier 1200 l’interdit sur le royaume de France, entraînant la suspension de toutes les activités du clergé. Cette situation risquant de créer des émeutes, Philippe II finit par se soumettre, fait mine de faire revenir Ingeburge à la cour. Lors d’une assemblée tenue le 7 septembre 1200 au château de Saint Léger à Nesle, il annonce que l’interdit est levé. Mais il l’enferme à Dourdan et reste auprès d’Agnès de Méranie. En mars 1201, le concile de Soissons se conclut par l’échec de Philippe Auguste à faire casser son mariage avec Ingeburge.
En juillet 1201, Agnès de Méranie meurt en donnant naissance à un 3ème enfant qui meurt peu après sa naissance. Philippe Auguste parvient à faire reconnaître du pape la légitimité des enfants nés d’Agnès.
Elle est inhumée en l’abbaye royale de Saint Corentin à Septeuil à une quinzaine de kilomètres au Sud de Mantes.