Élève de Pythagore , il naît probablement en Italie, à Crotone [1]. Pupille et transcripteur de Pythagore, après la mort de son maître et durant la persécution des pythagoriciens, il vit à Crotone. Il aurait été l’un des survivants de l’incendie de l’École de Crotone avec Lysis de Tarente et Archippe de Tarente.
Philolaos, contraint de fuir, se réfugie d’abord à Thèbes-de-Lucanie. Vers 400 av. jc, il écrit son livre. Pour la première fois, le pythagorisme n’est plus oral.
En 399, Lysis de Tarente, réfugié à Thèbes, y meurt. Philolaos va honorer sa tombe, et c’est durant ce voyage qu’il s’entretient avec Cébès de Thèbes qui conte sa rencontre à Platon. Platon s’empresse d’aller suivre son enseignement et celui d’Eurytos en Italie, en 389/388 av.jc.
Philolaos a écrit beaucoup, et toutes ses pensées il les a rassemblées dans un seul livre De la nature (Peri physeôs). Ce livre dont il ne reste que quelques fragments a connu un très grand succès dans l’Antiquité.