Le 18 août 1503, le pape Alexandre VI mourait. Le 16 septembre s’ouvraient les délibérations du conclave pour l’élection de son successeur. Deux candidats s’opposaient : le cardinal Georges d’Amboise, ministre de Louis XII, soutenu par César Borgia, et le cardinal Julien della Rovere, le futur Jules II. Pour éviter de longues discussions, les électeurs se mirent d’accord, dès le 22 septembre, sur le nom du cardinal François Todeschini-Piccolomini, neveu de Pie II, qui prit le nom de Pie III en souvenir de son oncle maternel.
Pie III déclara aussitôt vouloir être le pape de la paix. Il fait intervenir l’armée de Louis XII pour sortir celle des Borgias des États pontificaux. Il souhaitait la réforme générale de l’Église et la pacification de tout l’Occident, mais il mourut, moins d’un mois après son élection, le 18 octobre 1503. Il fut inhumé à la basilique Saint-Pierre, puis ses restes furent transférés à l’église San Andrea della Valle, aux côtés de ceux de Pie II.
Jules II (neveu de Sixte IV) lui succède.
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