Fils d’Enguerrand de Boves et d’Ade de Marle. Avant de partir en croisade, il fut marié en premières noces avec Ide de Hainaut, fille de Baudouin II de Hainaut et veuve de Guy de Chièvres.
Parti en avril 1096 avec son père pour la 1ère croisade, Thomas s’y couvrit de gloire et participa à plusieurs batailles, Nicée en juin 1097, Dorylée en juillet 1097, Al-Bara en décembre 1097, Antioche en juin 1098, et en juillet 1099 Jérusalem où il fut l’un des premiers croisés à y entrer.
Rentré au pays, certainement frustré et déçu du peu de profit d’une si longue expédition en Terre sainte, installé dans la forteresse de Montaigu, il se mit à ravager et dévaster les régions autour de Laon, d’Amiens à Reims.
Enguerrand de Boves, son père, en fut fort mécontent et fit le siège de la forteresse avec Ebles II de Roucy, fils d’Hildouin, André de Roucy, seigneur de Ramerupt, son frère, Hugues dit le Blanc, seigneur de Laferté, Robert de Péronne, seigneur de Crespy.
Thomas de Marle, averti, s’échappa et alla rejoindre, Louis, fils du roi Philippe 1er, dont il obtint du secours et fit lever le siège.
Vers 1102, il épousa en secondes noces une fille de Roger, seigneur de Montaigu et d’Ermengarde. Ce mariage fut annulé en 1104 pour cause de consanguinité. Thomas perdit la forteresse de Montaigu après la dissolution de son mariage avec l’héritière de Montaigu.
En troisièmes noces, il épousa en 1104 Mélisende de Crécy, fille de Guy, seigneur de Crécy
En 1113, les habitants d’Amiens obtinrent du roi Louis VI le Gros la permission de s’établir en commune.
Avec le support de leur évêque, Geoffroy et du vidame Guermond, ils demandèrent à Thomas de Marle de les soutenir dans leurs œuvres contre Adam, le châtelain qui tenait la garde de la Tour du Castillon, et Enguerrand, le comte son père. Mais Thomas se réconcilia avec son père et combattit avec lui contre les habitants d’Amiens. Thomas s’empara des terres et villages avoisinants, commit désordres et cruautés.
Sibylle de Château-Porcien, sa belle-mère qui le tenait en inimitié, le trahit en avertissant Gormond de Picquigny de ses agissements. Guermond lui tendit une embuscade et le blessa grièvement d’un coup de lance dans le jarret. Thomas se réfugia en son château de Marle. Gormond de Picquigny en profita pour attaquer le château où Adam commandait. Il obtint le soutien du roi Louis VI qui lui envoya du renfort qui entra à Amiens le 11 avril 1115
Revenu à Marle pour se soigner, il chercha à se venger et fit exécuter Gautier, archidiacre de Laon, demi-frère de Sibylle de Château-Porcien, qui avait soutenu son mariage adultérin et qui était un des principaux instigateurs de la révolte des Amiènois. Le clergé décida alors de l’excommunier lors d’un synode tenu à Beauvais le 6 décembre 1114.
Comme il continuait ses méfaits, le roi fut contraint de l’assaillir ; il lui enleva les châteaux de Crécy et de Nouvion et ruina les forts érigés sur les terres appartenant à l’abbaye Saint-Jean de Laon. Le roi assiégea ensuite la tour de Castillon et la rasa après 2 ans de siège.
Thomas fit la paix avec le roi contre une grande somme de deniers et la promesse qu’il fit de réparer tous les dommages faits à l’église.
Après la mort d’Enguerrand de Boves en 1116, le roi Louis VI le Gros confia en 1117 le comté d’Amiens à Adèle de Vermandois, fille d’Herbert IV et d’Adèle ou Alix de Crespy, elle-même fille de Raoul, comte d’Amiens. Adèle de Vermandois le donna aussitôt en dot à sa fille née d’un second mariage avec Renaud II de Clermont, Marguerite de Clermont qui se maria à Charles 1er de Flandre qui prie aussi le titre de comte d’Amiens. Pour se venger de ce que le roi avait donné le comté d’Amiens qui devait lui revenir de droit suite à la mort de son père, Thomas s’allia à Baudouin, comte de Hainaut et Hugues, comte de Saint-Pol. En 1130, il tua Henri de Vermandois, seigneur de Chaumont-en-Vexin, fils d’Adèle de Vermandois, et frère du comte Raoul 1er de Vermandois dit le Vaillant.
En octobre 1130, il fut grièvement blessé par le comte Raoul de Vermandois lors du siège de Coucy ordonné par le roi Louis VI qui voulait en finir avec les exactions de son vassal. Thomas de Marle rendit l’âme le 9 novembre 1130. Raoul de Vermandois vengeait ainsi la mort de son frère Henri.
Thomas fut inhumé sous la tour de l’église abbatiale de l’abbaye de Nogent sous Coucy.
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